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La Fundación Jardín Botánico del Quindío es una entidad  sin ánimo de lucro, constituida como organización no gubernamental, cuya personería jurídica le fue reconocida por la Gobernación del Quindío por medio de la Resolución No. OJ 037 del 5 de junio de 1979. Está debidamente inscrita en la Cámara de Comercio de Armenia. El Instituto de Investigación de Recursos Biológicos “Alexander von Humboldt” le dio concepto favorable conforme a las estipulaciones de la ley 299 de 1996 y en consecuencia la Corporación Autónoma Regional del Quindío le otorgó el permiso ambiental por medio de la Resolución No. 968 del 30 de octubre de 1998, y así se convirtió en el primer jardín botánico del país en quedar debidamente legalizado. Tiene el NIT Nº 890.0035.78-8. 

El Jardín Botánico del Quindío fue fundado en 1979 por Alberto Gómez Mejía, como  un centro de investigación científica, conservación ecológica y educación ambiental, atendiendo la sugerencia que le había hecho el famoso botánico Jesús M. Idrobo. Participaron  miembros de la Organización Oikos y del Club de Jardinería de Armenia, y profesores de la Universidad del Quindío. El Jardín fue abierto al público el 16 de diciembre de 2000 y desde entonces ha ejercido el liderazgo del Ecoturismo regional.

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